2020年秋学期 - メタボローム解析実習 / METABOLOME ANALYSIS LABORATORY PRACTICE
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65200 メタボローム解析実習 METABOLOME ANALYSIS LABORATORY PRACTICE |
先端開拓科目-環境情報-生命と身体 Frontier Courses (Advanced) - Environmental Information - Life Science 2 単位 |
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C2066 メタボローム解析実習 METABOLOME ANALYSIS LABORATORY PRACTICE |
先端開拓科目-環境情報-生命と身体 Frontier Courses (Advanced) - Environmental Information - Life Science 2 単位 |
| 実施形態 | オンキャンパス |
| 開催日程 | 秋学期 |
| 担当教員 | 曽我 朋義:平山 明由（ソガ トモヨシ:ヒラヤマ アキヨシ） |
| 関連科目 |
前提科目（関連）: C2065 |
| 開講場所 | TTCK |
| 授業形態 | 講義、実習・演習 |
| 履修者制限 |
履修人数を制限する Only the selected students can take this course. |
| 履修条件 | |
| 使用言語 | 日本語 |
| 連絡先 | soga@sfc.keio.ac.jp |
| 授業ホームページ | |
| 同一科目 | |
| 学生が利用する予定機材/ソフト等 | |
| 設置学部・研究科 | 総合政策・環境情報学部 |
| 大学院プロジェクト名 | |
| 大学院プロジェクトサブメンバー | |
| ゲストスピーカーの人数 | 0 |
| 履修選抜・課題タイプ=テキスト登録可 | false |
| 履修選抜・選抜課題タイプ=ファイル登録可 | false |
| GIGAサティフィケート対象 | |
| 最終更新日 | 2020/07/08 14:38:12 |
科目概要
メタボローム解析実習は、(1)分析化学技術、(2)細胞内代謝物質の測定法（代謝物質の抽出法、キャピラリー電気泳動質量分析法（CE-MS)による代謝物質の測定法）(3)メタボロームデータ解析の講義と実習をとおして、メタボローム研究の実際を体系的に理解することを目的としています。最先端のメタボローム測定手法の原理、測定法を学び実試料の細胞中の代謝物質を網羅的に測定し、ダイナミックな代謝変動を解析、考察します。
Students learn about the principles and measurement methods of the capillary electrophoresis-mass spectrometer (CE-MS), the most advanced metabolome measurement technique. Students comprehensively measure metabolic substances in the real samples and analyze dynamic changes in metabolism.
授業シラバス
主題と目標／授業の手法など
(1)分析化学技術、(2)細胞内代謝物質の測定法（代謝物質の抽出法、キャピラリー電気泳動質量分析法による代謝物質の測定法）(3)メタボロームデータ解析の講義と実習を行う。
メタボローム測定で扱う試料は発酵食品を予定（諸事情により変更する場合あり）。
Students learn capillary electrophoresis mass spectrometry (CE-MS) technology, metabolomics analysis methods based on CE-MS including metabolite extraction procedures and data analysis using real samples.
教材・参考文献
メタボローム研究の最前線、
Soga, T., et al., J. Biol. Chem. 281, 16768-16776, 2006、
Soga, T., et al., J. Proteome Res. 2, 488-494, 2003
提出課題・試験・成績評価の方法など
出席と毎日の小テストの結果、実習態度、実習中の質問等で成績を評価する
Academic achievements are evaluated by short tests, questions and answers and dedication to the class.
履修上の注意
TTCK生のみ履修可
This class is open to the TTCK students.
授業計画
第1回 分離分析法の原理およびペーパークロマトグラフィー実習
[ Basics of separation science]
Paper chromatography
曽我朋義、平山明由:Soga, Hirayama
第2回 キャピラリー電気泳動法（CE）の装置、原理、アプリケーション
[Basics of CE-MS 1]
Instrument principle and application of CE
曽我朋義、平山明由:Soga, Hirayama
第3回 キャピラリー電気泳動-質量分析計（CE-MS）の装置、原理
[Basics of CE-MS 2]
Instrument principle and application of CE-MS
平山明由:Hirayama
第4回 CE-MSによるメタボローム測定への応用、細胞からの代謝物質抽出法
[Metabolome analysis by CE-MS 1]
Extraction procedures from cells and tissues
平山明由:Hirayama
第5回 CE-MS実習（1）CE-MSによるアミノ酸の分析-1
[Metabolome analysis by CE-MS 2]
Positively charged metabolite analysis 1
平山明由:Hirayama
第6回 CE-MS実習（1）CE-MSによるアミノ酸の分析-2
[Metabolome analysis by CE-MS 3]
Positively charged metabolite analysis 2
平山明由:Hirayama
第7回 CE-MS実習（2）CE-MSによる陰イオン性代謝物質の分析-1
[Metabolome analysis by CE-MS 4]
Negative charged metabolite analysis 1
平山明由:Hirayama
第8回 CE-MS実習（2）CE-MSによる陰イオン性代謝物質の分析-2
[Metabolome analysis by CE-MS 5]
Negative charged metabolite analysis 2
平山明由:Hirayama
第9回 発酵食品から代謝物質の抽出
[Metabolome analysis by CE-MS 6]
Metabolite extraction from real samples
平山明由:Hirayama
第10回 発酵食品のメタボローム測定
[Metabolome analysis by CE-MS 7]
Metabolome analysis of real samples 1
平山明由:Hirayama
第11回 発酵食品の評価
[Metabolome analysis by CE-MS 8]
Metabolome analysis of real samples 2
平山明由:Hirayama
第12回 メタボロームデータ解析
[Metabolome analysis by CE-MS 9]
Data analysis
平山明由:Hirayama
第13回 質問、まとめ、課題、レポート
[Conclusion, assignment and report ]
平山明由:Hirayama
第14回 質問、まとめ、課題、レポート
[Conclusion, assignment and report ]
平山明由:Hirayama
第15回 質問、まとめ、課題、レポート
[Conclusion, assignment and report ]
平山明由:Hirayama
15回目に相当するその他の授業計画
質問、まとめ、試験、レポート
Conclusion, test and report